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감염병·질병예방관리사업, 의·약무 관리, 모자보건사업, 건강생활실천사업, 맞춤형 방문보건사업, 금연사업, 재활 및 노인보건사업, 정신보건사업, 진료사업 등의 업무를 담당하고 있다.
평택보건소는 2001년 보건사업과, 의무과, 보건지소 10개소, 보건진료소 11소를 두었고 2006년 송탄보건지소가 송탄보건소로 승격돼 분리된 후 현재 보건사업과, 건강증진과, 6개 보건지소, 7개 보건진료소로 구성돼 있다. 송탄보건소는 보건사업과와 건강증진과 및 3개 보건지소, 4개 진료소로 구성돼 북부 10개 면·동의 보건사업을 관할한다.

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